台灣高鐵在機電標部分捨棄原本的歐洲系統，改採日系新幹線系統，引發歐洲高鐵聯盟向國際商會申請仲裁，仲裁結果，台灣高鐵要賠7304萬美金，相當24億台幣。對於這筆費用，台灣高鐵表示將由全體股東承擔，至於是否接受仲裁結果，台灣高鐵表示，將與律師團再做進一步的了解。

台灣高鐵在機電標部分捨棄原本的歐洲系統，改採日系新幹線系統，引發歐洲高鐵聯盟向國際商會申請仲裁，仲裁結果，台灣高鐵要賠7304萬美金，相當24億台幣。對於這筆費用，台灣高鐵表示將由全體股東承擔，至於是否接受仲裁結果，台灣高鐵表示將與律師團再做進一步的了解。

才高高興興的慶祝車體出場，不料這個捨棄原本取得優先議價權的歐鐵聯盟，改採日系新幹線合作的政策卻遭來台幣24億天價的求償。台灣高鐵資深副總林天送：「這3年多來經過不斷的辯論和協商，判斷書有一個金額出來，台灣高鐵公司必須補償歐鐵聯盟大約7304萬美金多一點，這一個診斷書的內容，我們的律師團已經在研究。」

1997年德國西門子和法國亞知通合組歐鐵聯盟，加入台灣高鐵，反對加入負責機電部分。然而在台灣高鐵取得合約之後，卻在96年的4月份開放日本新幹線加入平行競標，並且在99年底宣布由新幹線得標，這個結果引發歐鐵聯盟不滿。

先是在2000年的1月份，向台北的地方法院申請假處分遭到駁回，接著在2002年向國際商會提出8億美元，相當於200多億的賠償，而仲裁結果出爐，台灣高鐵判陪24億台幣，對於這起延宕3年的仲裁案落幕，台灣高形容是利空出盡。台灣高鐵資深副總林天送：「從這個角度來看，風險已經固定在那邊，有一個金額出來對我們，昨天在跟媒體講的是從某一個角度，這個是風險的確定，也就是利空出盡。」

對於目前集資並不順利的台灣高鐵，在賠償金額從原本的200多億減少到24億，不過這筆金額將由全體股東承擔，包括了富邦產險、太平洋電線電纜、長榮航空、東元電機以及大安路工程等五大原始股東，另外再加上行政院的開發基金，以及台糖等等，而由於有行政院的開發基金在內，等於是要由全體納稅人來同承擔。