依法院組織法第五十八條的規定，各級法院或分院，均相對配置有檢察署，因此，檢察機關亦分三級，分別為最高法院檢察署、高等法院檢察署及地方法院檢察署。依法院組織法第111條第一款規定，法務部對各級法院及分院檢察署有行政監督權，故就行政組織而言，檢察機關是隸屬於行政院所屬的法務部，與法院是隸屬於司法院並不相同。

在西元1980年代以前，當時「審檢不分隸」故把審跟檢的事項，通通規定在「法院組織法」中，而於1980年代「審檢分隸」後，「法院組織法」仍未因此而拆成二個法規，故「檢察官」的事項，雖規定在「法院組織法」中，但不會單純因為這樣，就把「檢察官」認定是隸屬在「司法院」之下。

各級法院及分院各「配置」檢察署，其「配置」乃屬行政系統之關係，僅為了方便行事，其職權之行使仍屬獨立，不受各級法院及分院之干涉。就行政組織而言，檢察機關是隸屬於行政院所屬的法務部，與法院是隸屬於司法院並不相同。

資料來源: http://163.32.108.6/curriculum/social/newspaper.files/k7-9social-11.files/11-q1.htm