至於「職權調查主義」與「當事人進行主義」，在訴訟構造上之差異，主要呈現在程序之進行與證據之調查兩方面。在程序進行方面之區分是當事人對於訴訟標的能否自由處分，當事人進行主義容許訴追人自由決定不起訴或撤回起訴，均無需附具理；但職權調查主義則是一旦證據充份，即規定訴人必須起訴，故於不起訴時須附具理由，起訴後除以證據不充分為理由並獲法院許可外，不許訴人撤回起訴。在調查證據方面，職權主義下，調查證據之順序、範圍、方法完全由法院決定，應傳喚之證人、鑑定人亦由法院訊問；反之在當事人主義下，法院無權干涉當事人之調查證據，「交互詢問」成為調查證據之主要方法，「交互詢問」中之「反對詢問」被認為係發見真實之利器且為不可剝奪之刑事被告基本人權（黃東熊教授著刑事訴訟法論參照）。

當事人進行主義，意思就是：遊戲由當事人開始、規則由當事人決定、進行快慢由當事人控制，一切主動之權利都在當事人自己

比如：你可能會看到這樣的文字「我國的民事訴訟程序採當事人進行主義」，這段文字的白話意思就是：

「現在你如果要提起一個民事官司，你是原告，你想告的人是被告，而原告與被告就叫做（當事人），要不要提告，你自己決定（就是當事人自己決定），要提出哪些證據，你自己決定（就是規則、舉證自己決定），要不要跟被告和解（就是不想繼續告了由兩邊當事人自己決定），要不要坐下來冷靜一下（合意停止訴訟四個月），訴訟快慢由自己控制」這樣就叫做當事人進行主義，換句話說，法院的法官都不管啦！只有聽兩邊說、看兩邊演戲！